実施した治療の効果判定にもPETは有用です。がん細胞は死滅するよりも先に活動性が低下するので、放射線治療や化学療法などを一定期間行った後にPETで病巣の変化を確認することで、治療方法の変更や治療期間の検討などを行うことができます。